Il est nécessaire de définir précisément les objectifs poursuivis par l'évaluation des services écosystémiques à son entame. De ces objectifs dépendront en effet les objets de l'évaluation (quels écosystèmes ? quels services écosystémiques ?, quels bénéficiaires ?, etc.), les méthodes d'évaluation à mobiliser, le choix des indicateurs à considérer, etc.