Les écosystèmes créent un micro-climat en jouant localement sur les variables climatiques telles que la température, l'humidité de l'air, la vitesse du vent en créant de l'ombre par le couvert végétal, en jouant un rôle de brise-vent, en évapotranspirant, etc. Plusieurs indicateurs permettent de mesurer ce service : les modifications locales de température, d'humidité et de vitesse du vent induites par la végétation, etc. Ce service, en maintenant certaines conditions climatiques, peut améliorer la production agricole et forestière.