Ces étapes d'évaluation sont les suivantes :
1. Définition des objectifs spécifiques de l'évaluation
2. Identification des objets de l'évaluation
3. Intégration des différents domaines de valeurs
4. Réalisation de l'évaluation
a. Biophysique
b. Sociale
c. Economique (si pertinent et nécessaire)
La méthodologie préconisée par la plateforme Wal-ES est amenée à être périodiquement enrichie avec les avancées de la recherche scientifique et les retours d'expériences des évaluations menées sur le terrain. Elle se veut transversale et applicable à différentes situations d'évaluation des services écosystémiques. Des compléments et adaptations seront donc probablement requis pour accompagner la mise en œuvre concrète d'une évaluation particulière.
Le document complet, mis au point par la plateforme Wal-ES, décrivant les quatre étapes de l'évaluation intégrée des services écosystémique est disponible en téléchargement.